ATCC 菌種庫采用多種專業(yè)保藏技術(shù)確保菌種的活性和穩(wěn)定性。其中，冷凍干燥保存法是先將微生物冷凍，然后利用升華現(xiàn)象除去水分，使細胞的生理活動停止，從而達到長期維持生命狀態(tài)的目的，該方法適用于絕大多數(shù)微生物菌種，包括噬菌體和立克次氏體等。液氮低溫凍存也是常用方法之一，能將菌種保存在極低溫度下，延長其保存時間。此外，還有傳代保存法，對于一些不能采用冷凍干燥等方法的菌種，通過定期轉(zhuǎn)接、培養(yǎng)來保存，但這種方法存在一些缺點，如菌種管棉塞容易發(fā)霉、菌株遺傳性狀易變異、反復(fù)傳代后病原性和形成生理活性物質(zhì)的能力降低、需要定期轉(zhuǎn)種工作量大且雜菌污染機會較多。液體石蠟覆蓋保存法可防止干燥，通過限制氧的供給削弱微生物代謝作用，適用于霉菌、酵母菌、放線菌及需氧細菌等的保存，但某些細菌和真菌不宜采用此法。懸液保存法是將微生物混懸于適當(dāng)溶液中進行保存，包括蒸餾水保存法、糖液保存法等，適用于霉菌、酵母菌及絕大部分放線菌等。