選擇適合特定實(shí)驗(yàn)的 ATCC 菌株需要考慮以下幾個(gè)關(guān)鍵因素:
- 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/span>
對(duì)于研究微生物在特定環(huán)境(如土壤、水體、極端環(huán)境等)中的生態(tài)功能,應(yīng)選擇來(lái)自相應(yīng)環(huán)境或者具有相似生態(tài)位的 ATCC 菌株。例如,研究海洋微生物對(duì)石油污染物的降解,可選擇從海洋環(huán)境中分離并保存的菌株,如某些假單胞菌屬(Pseudomonas)的 ATCC 菌株,它們?cè)诤Q蟓h(huán)境中具有降解石油烴類(lèi)的天然能力。
在開(kāi)發(fā)新的抗菌藥物或者評(píng)估現(xiàn)有藥物的抗菌活性時(shí),需要選擇對(duì)藥物敏感性不同的菌株。如銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginosa)ATCC 27853 常用于抗菌藥敏試驗(yàn),它對(duì)多種抗生素的敏感性和耐藥性模式比較明確,是檢驗(yàn)新抗生素藥效的理想菌株。
當(dāng)研究某種疾病的病原體及其致病機(jī)制時(shí),要根據(jù)目標(biāo)疾病選擇相應(yīng)的致病菌株。例如,研究金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)引起的皮膚感染,可選用金黃色葡萄球菌 ATCC 6538,它具有典型的致病性相關(guān)因子,能夠幫助研究人員了解細(xì)菌如何侵入宿主細(xì)胞、引發(fā)炎癥反應(yīng)等致病過(guò)程。
如果是研究微生物的基本生理特性,如細(xì)菌的生長(zhǎng)曲線(xiàn)、代謝途徑等,選擇模式菌株是一個(gè)很好的選擇。例如,對(duì)于細(xì)菌的基礎(chǔ)研究,大腸埃希菌(Escherichia coli)ATCC 25922 是一個(gè)常用的模式菌株,它的生長(zhǎng)特性和代謝機(jī)制已被廣泛研究,方便作為對(duì)照來(lái)觀察新的實(shí)驗(yàn)現(xiàn)象。
若要研究微生物的基因功能,可以選擇那些已經(jīng)有較為完整基因組信息的 ATCC 菌株。例如,釀酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)ATCC 9763,其基因組測(cè)序的完成有助于通過(guò)基因敲除、過(guò)表達(dá)等手段來(lái)研究基因與特定表型之間的關(guān)系。
基礎(chǔ)微生物研究
致病性研究
抗菌藥物敏感性測(cè)試
環(huán)境微生物研究
- 菌株特性
對(duì)于涉及基因操作或者長(zhǎng)期實(shí)驗(yàn)的研究,需要選擇遺傳穩(wěn)定性高的菌株。有些菌株在傳代過(guò)程中容易發(fā)生基因突變或者質(zhì)粒丟失等現(xiàn)象,這會(huì)影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的重復(fù)性和準(zhǔn)確性。例如,一些經(jīng)過(guò)基因工程改造的大腸桿菌菌株,其攜帶的重組質(zhì)??赡茉趥鞔^(guò)程中不穩(wěn)定,所以要選擇那些經(jīng)過(guò)驗(yàn)證、在特定條件下能夠保持質(zhì)粒穩(wěn)定遺傳的 ATCC 菌株。
了解菌株的代謝類(lèi)型,如發(fā)酵型、呼吸型等,以及代謝產(chǎn)物的類(lèi)型。例如,乳酸桿菌(Lactobacillus)ATCC 334 可以產(chǎn)生乳酸,在食品發(fā)酵或者研究有機(jī)酸代謝的實(shí)驗(yàn)中較為合適;某些真菌菌株能夠產(chǎn)生特定的酶,如黑曲霉(Aspergillus niger)ATCC 16404 可以產(chǎn)生淀粉酶、纖維素酶等多種酶類(lèi),用于酶學(xué)性質(zhì)研究或者工業(yè)酶生產(chǎn)的實(shí)驗(yàn)。
考慮菌株的最適生長(zhǎng)溫度、pH 值、需氧或厭氧條件等。例如,嗜熱鏈球菌(Streptococcus thermophilus)ATCC 19258 是一種嗜熱菌,最適生長(zhǎng)溫度在 40 - 45℃之間,適合在需要高溫培養(yǎng)環(huán)境的實(shí)驗(yàn)中使用;而雙歧桿菌(Bifidobacterium)屬的一些菌株是厭氧菌,如雙歧桿菌 ATCC 29521,在進(jìn)行培養(yǎng)和實(shí)驗(yàn)操作時(shí)需要嚴(yán)格的厭氧環(huán)境。
生長(zhǎng)條件
代謝特性
遺傳穩(wěn)定性
- 菌株背景信息和參考文獻(xiàn)支持
ATCC 官方網(wǎng)站通常會(huì)提供菌株的詳細(xì)培養(yǎng)方法、保存條件以及一些基本實(shí)驗(yàn)操作的標(biāo)準(zhǔn)流程。這些信息可以幫助實(shí)驗(yàn)人員判斷該菌株是否適合自己的實(shí)驗(yàn)條件和技術(shù)水平。例如,一些對(duì)培養(yǎng)條件要求苛刻的菌株,如某些苛養(yǎng)菌的 ATCC 菌株,只有按照嚴(yán)格的 SOP 進(jìn)行操作,才能保證菌株的正常生長(zhǎng)和實(shí)驗(yàn)的順利進(jìn)行。
查閱關(guān)于目標(biāo) ATCC 菌株的大量文獻(xiàn),了解其他研究人員在類(lèi)似實(shí)驗(yàn)中的使用情況。例如,如果前人在研究某種藥物對(duì)微生物細(xì)胞周期的影響時(shí)使用了某種 ATCC 菌株并取得了可靠的結(jié)果,那么在設(shè)計(jì)類(lèi)似的細(xì)胞周期相關(guān)實(shí)驗(yàn)時(shí),該菌株可以作為一個(gè)參考選擇。
已有的研究成果
標(biāo)準(zhǔn)操作流程(SOP)
- 法規(guī)和安全要求
某些菌株可能受到法律法規(guī)的限制,例如涉及生物恐怖主義風(fēng)險(xiǎn)的病原體(如炭疽芽孢桿菌某些強(qiáng)毒株),其獲取和使用受到嚴(yán)格的管控。在選擇菌株時(shí),要確保符合國(guó)家和地方的生物安全法規(guī)以及相關(guān)機(jī)構(gòu)的規(guī)定。
根據(jù)實(shí)驗(yàn)所在實(shí)驗(yàn)室的生物安全等級(jí)來(lái)選擇合適的菌株。例如,生物安全等級(jí) 1 級(jí)(BSL - 1)的實(shí)驗(yàn)室可以操作一些不具有致病性或者低致病性的菌株,如大腸埃希菌 ATCC 11775;而對(duì)于具有高致病性的菌株,如結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)的某些 ATCC 菌株,需要在生物安全等級(jí) 3 級(jí)(BSL - 3)或更高的實(shí)驗(yàn)室中進(jìn)行操作。
生物安全等級(jí)
相關(guān)法規(guī)限制